Bestuur
De Protestantse wijkgemeente Zeist-West maakt deel uit van de Protestantse Gemeente Zeist en behoort tot de Protestantse kerk in Nederland (PKN). Ook participeert zij in de Raad van Kerken in Zeist.
Wijkkerkenraad
De kerkenraad van de Protestantse wijkgemeente Zeist-West stelt het beleid van de wijkgemeente vast. Deze kerkenraad wordt gevormd door alle ambtsdragers: predikanten, ouderlingen, diakenen en ouderling-kerkrentmeesters. De kerkenraad komt in de regel eens in de zes weken bij elkaar.
Moderamen
De kerkenraad heeft een 'dagelijks bestuur', het moderamen genaamd. In dit moderamen hebben vier personen zitting: de predikant, de voorzitter van de kerkenraad, de scriba (secretaris) en een ouderling-kerkrentmeester. Het moderamen bereidt de kerkenraadsvergaderingen voor.
Wijkpredikant
In de Protestantse wijkgemeente Zeist-West is één vaste predikant werkzaam. De wijkpredikant heeft, naast het voorgaan in vieringen, doordeweeks een belangrijke rol in het kerkenwerk: in het bezoeken van mensen, in het begeleiden van gespreksgroepen en in het (mede) organiseren van activiteiten.